有证据表明，咖啡因可以降低心血管疾病的风险。然而，其机制尚未知。近期，加拿大学者发表研究结果称，咖啡因预防心血管疾病可能是因其可以降低“坏胆固醇”水平。
研究者分析了咖啡因对血液中“坏胆固醇”——低密度脂蛋白胆固醇（ldl-c）水平的两个调节因子：pcsk9(前蛋白转化酶枯草溶菌素/kexin9型)和低密度脂蛋白受体（ldlr）表达的影响。
细胞实验观察到，咖啡因降低循环pcsk9水平并增加肝脏低密度脂蛋白受体表达。而且咖啡因浓度越高，效果越明显。
研究者在小鼠实验中证实了细胞实验的结果，摄入咖啡因后小鼠血循环中pcsk9水平降低，肝细胞表明低密度脂蛋白受体增加，血液中甘油三酯及胆固醇含量明显降低。
随后，研究者进行了人体实验，在12例健康志愿者中证实了咖啡因降低pcsk9的效果。在摄入咖啡因2小时和4小时，血浆中pcsk9水平分别降低了25%和21%。